mboost-dp1

unknown

newz.dk folder proteiner

- Via newz.dk - , redigeret af hmn

Står din computer derhjemme i længere perioder uden at lave noget, eller den du har på arbejdet? Hvis det er tilfældet, så hjælp videnskaben, og gå i gang med at folde proteiner.

Ved at hjælpe med at folde proteiner, kan der opnås videnskabelige gennembrud, der kan hjælpe til med at forklare en lang række biologiske processer, f.eks. sygdomme, som man så bedre kan bekæmpe.

For ikke så længe siden blev der oprettet et newz.dk team (hold nr. 34688), og det har i de seneste dage modtaget flere medlemmer, men ved samlet kraft kunne det være sjovt og spændene at se om vi kunne lave det bedste og største hold i Danmark.

Folding@Home projektet fra Stanford universitetet i USA er et nonprofit foretagende, udelukkende lavet for at forstå proteinernes hemmeligheder.

Mere info kan læses i denne tråd, og statistik for newz.dk holdet kan findes her.





Gå til bund
Gravatar #101 - gRaBieS
22. feb. 2004 20:49
Og som en lille side-bemærkning; Der er stor forskel på hvor lang tid det tager at folde en WU. p700-serien tager typisk ikke mere end 8 timer, alt efter CPU, of coz. Hvor p600-serien på min XP2100+ tager omkring 2 døgn.
Gravatar #102 - Trinity
22. feb. 2004 21:08
Hm kunne være man skulle smide det på istedet for Distributed.net, det er sq noget skønnere at der bliver lavet noget for andre mennesker.
Gravatar #103 - Sattie
22. feb. 2004 21:13
hmm
p729_gsgs_md ca ½ time..
p917_v2180pf909 2½ time..
Hvor er jeres 8 timers pakker ?
Gravatar #104 - KingHans
22. feb. 2004 21:18
min tog ca. 8 timer... hvor ser man hvad den hedder/hed ??
Gravatar #105 - Sattie
22. feb. 2004 21:20
Det skriver den flot og tydeligt i console udgaven..
Gravatar #106 - vibeweb
22. feb. 2004 21:27
hmm.. så højt oppe har min p4 2.4 ghz ikke været oppe før.. 62 grader
Gravatar #107 - GandalfTheWhite
22. feb. 2004 21:53
Så skete det! newz.dk er officielt i top1000 på F@H :)))) Vi liggger pt. på en 996. plads, og det giver os hermed adgang til en helt ny stats-side! Det er nemlig sådan, at alle teams i top1000 som noget særligt har adgang til en "Fast Teampage", der loader meget meget meget meget hurtigere end den normale stats-side på F@H.

newz.dk Fast Teampage

Også på Extreme Overclocking, vil vi få adgang til en extra stats-side, der giver en detaljeret oversigt over hver enkelt brugers udvikling. Den sku' gerne komme med på siden efter næste opdatering.


Enjoy. Vi ses i top500 :)
Gravatar #108 - blackthorne_dk
22. feb. 2004 22:36
sweet !

Og mine WU's er ikke engang begyndt at tikke ind endnu...
Gravatar #109 - LeonM
22. feb. 2004 22:37
Man må da sige at de der gutter på Stanford har humor.

Server powered by:
Commodore 64
*Actual server specs may vary...

*gg* Højt !

Det er lidt sjovt det her. Har nu 1 server og 4 alm. computere på opgaven. Der kommer 1 server og et par alm. maskiner mere på i morgen !
Gravatar #110 - GandalfTheWhite
22. feb. 2004 22:57
#107 update: Ser ud til, at vi skal helt ned omkring top300 for at få den extra stats-side på Extreme Overclocking. Jeg undskylder fejlinformeringen :)
Gravatar #111 - ice2k2
22. feb. 2004 23:25
dejligt så skal man ikke vente 1000 år på at se ens stats...
Gravatar #112 - Redhack
23. feb. 2004 07:37
Når først alle Wu's bliver færdige så skal vi nok komme meget længere op på listen. Min har nået 200 af 400 så der går lidt tid i nu. Så mon ikke vi kan komme meget længere op?
Gravatar #113 - XorpiZ
23. feb. 2004 07:49
Så tror jeg også jeg fik joinet :D

En xp1600 der kører 8 timer om dagen i skolen :>
Gravatar #114 - TYBO
23. feb. 2004 07:59
#106 HunterKiller: jeps som jeg sagde: Det suger en masse strøm og jeres PCer bliver pisse varme af det.
Gravatar #115 - UraniumDeer
23. feb. 2004 08:10
RIGHT... Det er er sq da meget godt alt det her, kunne da godt finde på at joine teamet... Men ser man lidt Discovery en gang imellem, vil man vide at man HAR fundet en måde at stoppe kræft, og mange andre sygdomme, svaret var haj-blod (og de der blåblodede skal-agtige dyr som jeg ikke kan huske navnet på). De udførte nogle forsøg på nogle kaniner med kræft, den ene havde meget udbredt kræft i det ene øje, og den anden havde kun begyndene kræft. Efter at være blevet behandlet, forsvant den begyndene kræft HELT, og den udbredte stoppede helt.
Så man HAR en løsning på kræft, men det er alle de fucking tilladelser og etiske spørgsmål der sætter en stopper for det hele.
Ud over kræft mener man også at haj-blod, og blod fra det der andet dyr, også kan kurere andre sygdomme, men de fortalte dog ikke hvilke.

Anyways, rigtig godt initiativ, hopper måske på teamet på et tidspunkt.
Gravatar #116 - Odin
23. feb. 2004 08:14
sjovt, DK har fået ca. 140 IP'er mere siden F@H kom på newz.dk

http://folding.stanford.edu/maps/current.countries
Gravatar #117 - LeonM
23. feb. 2004 08:49
#114
Du kan jo bare sætte processorbelastningen ned !

#115
Jeg har også fulgt de udsendelser på Discovery og det passer ikke helt hvad du siger. Man har ganske rigtigt i et par få tilfælde kunne bremse kræft men kun ganske bestemte typer og kun i få tilfælde, det er absolut ikke ensbetydende med at man generelt kan helbrede kræft. Dette drejer sig også mere om at lære at forstå sygdomme som eks. kræft og med den viden så kunne helbrede.

#116
Egentligt sjovt at et land som Uruguay ligger over Danmark..

Det bliver sjovt at følge med de næste par dage for News.dk's team og se hvor mange WU'ere der tæller ind. Hvis man følger denne tråd så er det pænt mange mennesker som har tilkendegivet at de joiner teamet.
Gravatar #118 - Mifan
23. feb. 2004 09:06
#15 You've found the Cure for Cancer just by wathcing Discovery Channel... Dang! Tillykke! Du har vundet Civilization 3!
Nåh... sagde de noget om håbet for udviklingen af disse medikamenter?
Iøvrigt er det her projekt også rettet mod sygdomme som Alzheimers, Parkinson og derudaf... ikke kun kræft!
Gravatar #119 - eviscerator
23. feb. 2004 09:06
Jeg ved ikke om det bare er mig, men jeg synes ikke det fremgår tydeligt nogle steder hvor man downloader klienten ?
Gravatar #121 - klond
23. feb. 2004 09:29
Øv jeg kan ikke komme igennem på skolen men clienten.. Lidt surt. Men virker fint der hjemme. De har nok lukket for den port eller hvad kan der være galt?
Gravatar #122 - blackthorne_dk
23. feb. 2004 09:32
Som der står i licensen bør du nok holde dig til at installere det på maskiner du selv ejer...

Hvis du har aftalt med admin på skolen at installere det der, kan du vel også arrangere at åbne i firewallen til stanford.edu.
Gravatar #123 - Redhack
23. feb. 2004 09:52
#114 Tjaa min bliver MAX 48 grader når den er clocket fra 2500+ til 3200+ så jeg syntes ikke at du kan bruge det som en undskyldning.

Og strøm? tjaa så meget suger den sku' heller ikke. Man kan bare sætte den til at bruge max 50% af cpu'en.
Gravatar #124 - [E]Desperado
23. feb. 2004 10:52
Er der nogle af jer andre der har fået denne fejl efter setup
Proxy er sat.

[10:43:51] Opening http://folding.stanford.edu/cgi-bin/teampage?q=346...
[10:44:16] + Attempting to get work packet
[10:44:16] - Connecting to assignment server
[10:44:16] - Successful: assigned to (171.64.122.125).
[10:44:16] + News From Folding@Home: v.4 client available
[10:44:16] Loaded queue successfully.
[10:44:17] - Error: Attempt #7 to get work failed, and no other work to do.
Waiting before retry.

:)
Gravatar #125 - blackthorne_dk
23. feb. 2004 11:09
Self bruger ens PC noget mere strøm ved full load, men i mit tilfælde er det en stigning på max 25% på to maskiner. Varme er kun et problem hvis det får lov til at ophobe sig i lokalet. Åbn døren engang i mellem og lad det cirkulere til de andre lokaler?
Gravatar #126 - alapalooza
23. feb. 2004 11:55
Når jeg prøver at starte programmet 2 gange.. på en P4 2.6 HT
Siger den "Only one copy mey be run at a time".. ?

Når der kun er en kopi åben bruger den kun 50% CPU.
Gravatar #127 - NeophyteDK
23. feb. 2004 12:10
#100 når man nu har installeret den som service, hvor kan man så se hvad den laver..? udover at den æder fuldt ud cpu..

btw. jeg joinede i går aftes med min 24/7 2500+
Gravatar #128 - Herskegut
23. feb. 2004 13:02
Det er sjovt nok når man ser på Newz.dk holdets statistik, vi stormer fremad, jeg sad og så holdene hurtigt igennem her tidligere, og vi er de dem som er rykket flest pladser fremad de sidste 24 timer :)
http://folding.extremeoverclocking.com/index.php?&...

det går stærkt :)

btw, har smidt min 3Ghz HT igang med at folde lørdags, det er jo synd med alt den maskinkraft der går til spilde ;-)
og når strømmen er gratis, så kan man ikke sige nej.
Gravatar #129 - Sattie
23. feb. 2004 13:04
p690_L939_K12M_532K .. ond pakke at få! kommer mindst op på 8 timer ned den :(
Gravatar #130 - LeonM
23. feb. 2004 13:16
#128
Kan du få den til at bruge alle processorrecurser når du har en HT ?

Jeg har den (grafisk vertion) bla. kørende på 2 servere der hver har 2*2.8hz HT processore og den benytter kun 25% (dvs. ½processor). Jeg har sat affinity til at den skal bruge alle 4 uden at det hjælper.

Det er lidt tosset at den ikke kan indstilles til at bruge de resourcer der faktisk er til rådighed !

På alm. maskiner med 1 processor uden HT er det nemt nok at styre.
Gravatar #131 - [E]Desperado
23. feb. 2004 13:54
Nu er [E]Desperado også på.
2 X P4 2,66Ghz 512/533 24/7
2 X p4 2,40Ghz 512/400 24/7
1 X P4 2,00Ghz 1024/266 Random
1 x pIII 933Mhz 256/133 24/7
2 x PIII 733Mhz 256/133 24/7
1 x AMDXP 2,00Ghz 512/266 Random
Gravatar #132 - Herskegut
23. feb. 2004 13:56
#130
jeg kører med en console og en grafisk, så bruger hver af dem 50% cpu, easy og enkelt :)
Gravatar #133 - pointwood
23. feb. 2004 14:04
Ok, jeg er lidt sent ude, men her er lidt info til jer :)

Hvis man kører Windows 2000 eller Windows XP, så vil jeg klart anbefale at downloade console klienten og så installere den som en service. Der er allerede blevet linket til en lille utility der klarer den opgave. Personligt benytter jeg PizzaKings F@H Service Installer der er lavet af en fra det hold jeg støtter (Ars Technica Team Egg Roll). Hvis man har en dual eller en quad maskine, så kan den også håndtere det. Den installerer også automatisk en uninstaller så man let kan fjerne servicen igen. Derudover medfølger der også en ekstra lille utility til at konfigurere servicen, hvis man skulle have behov for at ændre nogle instillinger.

Hvis man gerne vil følge med i hvordan det går for sit hold og hvordan man selv klarer sig på holdet, så findes der også diverse tredjeparts stats sites - her er et par af dem:
Dyyryath's Arachnid Stats System
Statsman.info
Extreme OC

Hvis der er yderligere spørgsmål, så spørg - kontakt mig evt. via irc på irc.arstechnica.com #distributed eller via Jabber (se min signatur :)
Gravatar #134 - x3me-brain
23. feb. 2004 14:12
Er der nogen der kender tools svarende til SetiSpy, SetiDriver, SetiWatch osv. til F@H? De gør det hele meget nemmere.
Gravatar #135 - zoree
23. feb. 2004 14:35
Hey... har lige joinet med 2 maskiner 1Ghz 128Mb-ram

den ene maskine kører console og den anden grafisk. hvordan stopper jeg den console. for skal slukke maskinen når jeg går hjem. starter den bare det hvor jeg slukkede den hvis jeg bare lukker den?
Gravatar #136 - Pernicious
23. feb. 2004 15:16
#135

Hvis du ikke har den kørende som service, så bare Ctrl-C.
Gravatar #137 - blackthorne_dk
23. feb. 2004 15:27
#135 den laver nogle restore points, der gør at den ikke mister for mange beregninger ved en crash.

Til dem der kører SMP / HT. I skal starte en unik klient per CPU. Det er ikke nok at gå ind i samme dir og starte exe filen igen, det skal været en klient i sit eget dir. Derefter skal i dirigere ressourcerne over på den ledige CPU, jeg er ikke sikker på om det sker automatisk, eller om man skal gøre noget aktivt for det. Jeg har desværre kun denne info, som jeg fandt på F@H's side, da jeg ikke selv har noget SMP system.
Gravatar #138 - Chewy
23. feb. 2004 15:34
Ok, har lige et par spørgsmål...

For det første kan jeg hellere ikke helt se hvordan i får en wu til ca. 8 timer...
Har en PII 400 mhz som har stået i to døgn, og jeg er allerede oppe på 255 wu (http://vspx27.stanford.edu/awards/cert.php?u=Chewy&pts=255&t=wus&bg=3)..

Udover det så har jeg fra starten haft newz.dk stående som hold, men det er hverken blevet tilføjet til min egen stat side eller newz.dk´s..

Nogen gode idéer???
Gravatar #139 - GandalfTheWhite
23. feb. 2004 15:38
#138: Fordi der i forvejen er en bruger, der hedder Chewy.
Gravatar #140 - PikkeMand
23. feb. 2004 15:43
Sådan Team Newz.dk!
Vi er nu rykket fra en 996. plads, til en pt. 926. plads! og det er på under 17 timer!!! (taget i forhold til post #107)
Gravatar #141 - ice2k2
23. feb. 2004 15:53
#138 som 139 siger, er der en som hedder det allerede... men du kommer også først på listen når du har uploaded 1 wu.

grunden til at det tager så lang tid kommer an på din cpu. det er jo cpu kraft den bruger for at regne det hele ud, og hvis det tager en 2ghz ca 8 timer at lave 1 wu tager det self meget lang tid før den er færdig på en 400mhz, men den skal nok blive færdig, og det er det samlede resultat der tæller. så du behøver ikke bekømre dig, ellers kan du bruge progammet til at teste din stabilitet om ikke andet...
Gravatar #142 - UraniumDeer
23. feb. 2004 16:00
Yus... så har jeg joinet... med en ThoroughBred 2400+
Tilføjer MÅSKE 1900+, og 2* 2500+ senere...
Gravatar #143 - Acro
23. feb. 2004 16:02
#114 TYBO:
Ja, men til gengæld kan vi håbe på, at forskningen kan benyttes til at kurrere sygdomme, og til at forstå vores verden bedre. I mine øjne er det er en ret lav pris at betale, og jeg er sikker på, at du også gerne vil høste den viden, som resultatet kan give.

#115 UraniumDeer:
Den forskning som Folding@home laver, er blandt andet at undersøge påvirkningerne af forskellige proteiner. Ingen kan forudse hvilke konsekvenser, som det vil have at behandle mennesker med blod fra hajer, og derfor er det farligt også selv, at det på kort sigt kan gavne.
Gravatar #144 - PikkeMand
23. feb. 2004 16:19
jeg kan heller ikke helt få de 8 timer per WU til at passe... Har regnet 1 procent på en WU, hvilket har taget 23 min. (kan ses i log'en). Lidt hurtig regning giver 38 1/3 time per WU.
Jeg kører på en 2,6 GHz Celeron, hvilken jeg synes burde yde lidt bedre end 38 1/3 time per WU, da den da får rundt regnet 90% af processorkraften.
Jeg kører ellers den tekst-baserede "no-bullshit" version som service, hvilket jeg ville mene var mest effektiv.
Jeg har ydremere tjekket at den benytter SSE og den Core der er optimeret til nyere processorer.

nogle ideer?
Gravatar #145 - Psycho
23. feb. 2004 16:20
nå jeg tror da også jeg bare lige joiner for sjov :)
Så adder lige min 2*Opteron 1.8 Ghz til newz.dk teamet :)
Gravatar #146 - Sattie
23. feb. 2004 16:25
#144 og andre
Som tidligere nævnt er der ikke en fast enhedstid pr wu.
Alt sammen afhænger af hvor mange point de giver, jo flere, jo længere tid.
I kan evt. tjekke her:
http://folding.stanford.edu/psummary.html
Gravatar #147 - sleizer
23. feb. 2004 16:44
har også joinet... 1*3 Ghz fra mig.. er p ca 280/600 på min første WU
Gravatar #148 - GandalfTheWhite
23. feb. 2004 16:47
Ska' vi lige for en gangs skyld få sat på plads, at der er meget stor forskel på kompleksiteten af de forskellige WU's. Der er derfor lige så stor forskel på, hvor lang tid det tager at lave en :)

Det kan ses her hvor mange point en given WU indbringer.

Her er et lille snip fra F@H FAQ:

How do you decide how much credit a work unit is worth?

How do you determine how many points a work unit is worth? Before putting out any new work unit, we benchmark it on a dedicated 500MHz Celeron machine (this machine does not have SSE/3DNow). We plug the results of this into the following formula:

points = 3.5 * multiplier * (daysPerWU)

where daysPerWU is -- no surprise -- the number of days it took to complete the unit.

How do you set the deadlines for the work units?

Each work unit is benchmarked on a dedicated 500 MHz Celeron machine without SSE/3DNow. We look at how many days it takes, and multiply this by 2.5. This corresponds to requiring such a machine to fold less than 10 hours a day in order to meet the deadline. From our experience, the majority of donor machines are faster than our benchmarking machine, and virtually none are slower, so this shouldn't be a problem (if a machine is slower, it may need to fold more hours a day). Occasionally, deadlines may be set longer than the above calculation indicates, but the reason for having deadlines at all is that the sooner we get back work units, the sooner we can put the results to good use. We are looking into, in the very near future, having the assignment server take machine speed into account in making assignments, thereby allowing slower machines to receive smaller work units.
Gravatar #149 - LeonM
23. feb. 2004 18:00
Det er egentligt ret nemt.

Proteiner er meget forskellige, i dette tilfælde er det mest et spørgsmål om hvor mange atomer som det enkelte protein består af (derfor den store forskel i tiden det tager at behandle en WU og deraf et pointsystem som tager højde for dette)
Hvis man syntes at man har en kraftig computer/server og det alligevel tager lang tid at behandle en given WU så skal man ikke fortvivle, brugeren/teamet får bare flere point for WU'en når den er færdig.

Lidt kritik skal der dog være plads til:

Hvis man har enten en multiprocessor computer eller en singelprocessor med HT så virker programmet ikke optimalt, dette gælder både dos og windows-vertionen (har ikke testet de andre)
Det er forholdsvist nemt at skrive sit program så det tager højde for dette og det er lidt underligt at teamet på Stanford ikke har håndteret det lidt bedre i deres programmer.
Gravatar #150 - x3me-brain
23. feb. 2004 19:51
Er der et sted hvor jeg kan se en oversigt over hvilke core versioner der er, og hvad de er gode til?
Gå til top

Opret dig som bruger i dag

Det er gratis, og du binder dig ikke til noget.

Når du er oprettet som bruger, får du adgang til en lang række af sidens andre muligheder, såsom at udforme siden efter eget ønske og deltage i diskussionerne.

Opret Bruger Login